Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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HDAC10Q969S8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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