Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms