Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRTOMTQ8WZ04 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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