Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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ZNF548Q8NEK5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZNF548Q8NEK5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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