Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MICAL3Q7RTP6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms