Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MFSD6Q6ZSS7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MFSD6Q6ZSS7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms