Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4L9Q6RFH8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms