Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms