Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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C10orf55Q5SWW7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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C10orf55Q5SWW7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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