Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms