Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms