Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDCCQ504Y2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms