Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms