Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms