Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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