Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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