Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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