Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD2Q16342 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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