Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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