Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CDK5R1Q15078 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms