Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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