Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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