Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ATRQ13535 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRQ13535 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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