Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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FOXE3Q13461 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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