Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACACAQ13085 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms