Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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