Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TWF1Q12792 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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