Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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FOXO1Q12778 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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FOXO1Q12778 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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