Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms