Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1002.8 ms