Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms