Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MS4A2Q01362 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms