Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX1P83916 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CBX1P83916 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX1P83916 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX1P83916 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CBX1P83916 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms