Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELF3P78545 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELF3P78545 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms