Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFM1P61960 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms