Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCALDP61601 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCALDP61601 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCALDP61601 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCALDP61601 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms