Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VSX2P58304 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VSX2P58304 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VSX2P58304 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms