Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTBP2P56545 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTBP2P56545 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms