Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCR1P46094 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCR1P46094 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms