Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACADSBP45954 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms