Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXD13P35453 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms