Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN4P29074 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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