Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKBIAP25963 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms