Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms