Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA6P23229 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms