Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms