Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms