Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBP07199 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBP07199 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms