Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FGF1P05230 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FGF1P05230 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FGF1P05230 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms