Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PRM2P04554 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PRM2P04554 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms